Objetivo. Estimar el costo anual del Programa Nacional de Detección Oportuna de Cáncer Cervical en el Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS). Material y métodos. Este análisis de costos examinó las distintas coberturas por región reportadas por el IMSS. Se estimó el número de citologías, colposcopías, biopsias y evaluaciones de patología y los costos de pruebas de diagnóstico y de tratamientos por neoplasia cervical intraepitelial de grado II y III (NIC 2/3) y cáncer cervical. Los costos de las pruebas de diagnóstico se estimaron utilizando una técnica de microcosteo. Se llevó a cabo un análisis de sensibilidad. Resultados. El costo de realizar 2.7 millones de citologías fue de 38 millones de dólares, lo que representa 26.1% del costo total del programa (145.4 millones). Los falsos negativos corresponden a casi 43% de los costos del programa. Conclusiones. La baja sensibilidad de la citología genera un alto número de falsos negativos que resultan en costos elevados para la institución por el tratamiento de estos casos no detectados. Palabras clave: costos y análisis de costos; citología; detección; cáncer cervical; México.